Line 64: |
|
|Largest contig||2 198 457||3 4848 77||1 936 831||1 948 632||2 104 087||1 169 224||1 439 551 |
|
|Largest contig||2 198 457||3 4848 77||1 936 831||1 948 632||2 104 087||1 169 224||1 439 551 |
|
|- |
|
|- |
- |
|Total length||4 808 733||4 706 800||4 705 398||4 745 036||
|
+ |
|Total length||4 808 733||4 706 800||4 705 398||4 745 036||4 741 512||4 814 718||4 749 785
|
|
|- |
|
|- |
- |
|N50||1 005 770 ||3 484 877||966 809||1 434 284||
|
+ |
|N50||1 005 770 ||3 484 877||966 809||1 434 284||1 655 500||676 526||1 168 010
|
|
|- |
|
|- |
|
| style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||| |
|
| style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||| |
Line 72: |
- |
|# misassemblies||19||9||12||15||
|
+ |
|# misassemblies||19||9||12||15||14||17||11
|
|
|- |
|
|- |
- |
|Misassembled contigs length ||2 939 040||3 530 352||2 949 761||3 653 461||
|
+ |
|Misassembled contigs length ||2 939 040||3 530 352||2 949 761||3 653 461||3 820 624||2 387 129||3 986 402
|
|
|- |
|
|- |
- |
| style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies||||||||||||
|
+ |
| style="background:#f0f0f0;"| Mismatches||||||||||||
|
|
|- |
|
|- |
- |
|# mismatches per 100kbp||0.8||0.43||0.58||1.36||
|
+ |
|# mismatches per 100kbp||0.8||0.43||0.58||1.36||0.15||0.95||0.58
|
|
|- |
|
|- |
- |
|# indels per 100kbp||5.71||2.98||4.45||9.56||
|
+ |
|# indels per 100kbp||5.71||2.98||4.45||9.56||1.77||8.02||6.88
|
|
|- |
|
|- |
- |
|# N's per 100kbp ||0||0||0||0||
|
+ |
|# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0||0||0||
|
|
|- |
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|- |
|
| style="background:#f0f0f0;"| Genome Statistics|||||||||||| |
|
| style="background:#f0f0f0;"| Genome Statistics|||||||||||| |
Line 86: |
- |
|Genome fraction(%) ||100||100||99.815||99.87||
|
+ |
|Genome fraction(%) ||100||100||99.815||99.87||100||99.995||99.979||
|
|
|- |
|
|- |
- |
|Duplication ratio ||1.037||1.016||1.017||1.025||
|
+ |
|Duplication ratio ||1.037||1.016||1.017||1.025||1.022||1.038||1.025
|
|
|- |
|
|- |
- |
|# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4480+7part||4485+9 part||
|
+ |
|# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4480+7 part||4485+9 part||4494+3 part||4493+4 part||4492+5 part
|
|
|- |
|
|- |
|
|NGA50 ||615 234||1 205 052||572 342||875 953|| |
|
|NGA50 ||615 234||1 205 052||572 342||875 953|| |