Version Differences for HGAP

(→Performance)
(→Performance)
Line 161:
       
  |-    |- 
- |# contigs||16||   + |# contigs||16  
  |-    |- 
- |Largest contig||2 198 457||3 4848 77||1 936 831||1 948 632||2 104 087||1 169 224||1 439 551   + |Largest contig||2 198 457  
  |-    |- 
- |Total length||4 808 733||4 706 800||4 705 398||4 745 036||4 741 512||4 814 718||4 749 785   + |Total length||4 808 733  
  |-    |- 
- |N50||1 005 770 ||3 484 877||966 809||1 434 284||1 655 500||676 526||1 268 010   + |N50||1 005 770  
  |-    |- 
- | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''||||||||||||||   + | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''||  
  |-    |- 
- |# misassemblies||19||9||12||15||14||17||11   + |# misassemblies||19  
  |-    |- 
- |Misassembled contigs length ||2 939 040||3 530 352||2 949 761||3 653 461||3 820 624||2 387 129||3 986 402   + |Misassembled contigs length ||2 939 040  
  |-    |- 
- | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||||||||   + | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||  
  |-    |- 
- |# mismatches per 100kbp||0.8||0.43||0.58||1.36||0.15||0.95||0.58   + |# mismatches per 100kbp||0.8  
  |-    |- 
- |# indels per 100kbp||5.71||2.98||4.45||9.56||1.77||8.02||6.88   + |# indels per 100kbp||5.71  
  |-    |- 
- |# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0||0||0   + |# N's per 100kbp ||0  
  |-    |- 
- | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''||||||||||||||   + | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''||  
  |-    |- 
- |Genome fraction(%) ||100||100||99.815||99.87||100||99.995||99.979   + |Genome fraction(%) ||100  
  |-    |- 
- |Duplication ratio ||1.037||1.016||1.017||1.025||1.022||1.038||1.025   + |Duplication ratio ||1.037  
  |-    |- 
- |# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4480+7 part||4485+9 part||4494+3 part||4493+4 part||4492+5 part   + |# genes ||4494+3 part  
  |-    |- 
- |NGA50 ||615 234||1 205 052||572 342||875 953||844 482||633 220||1 267 242   + |NGA50 ||615 234  
  |-     |-  
- |'''Running Time'''||19hr 06m||13hr 34m||13hr 21m||12hr 38m||   + |'''Running Time'''||19hr 06m  
  |-    |- 
  |}    |}