Version Differences for HGAP

(→Performance)
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Line 253:
  |Total length||5 178 932||5 176 592||5 176 771||5 182 410    |Total length||5 178 932||5 176 592||5 176 771||5 182 410 
  |-    |- 
- |N50||1 005 770 ||3 484 877||966 809||1 434 284||1 655 500||676 526||1 268 010   + |N50||1 005 770 ||3 484 877||966 809||1 434 284  
  |-    |- 
- | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''||||||||||||||   + | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''||||||||  
  |-    |- 
  |# misassemblies||19||9||12||15||14||17||11    |# misassemblies||19||9||12||15||14||17||11 
Line 261:
- |Misassembled contigs length ||2 939 040||3 530 352||2 949 761||3 653 461||3 820 624||2 387 129||3 986 402   + |Misassembled contigs length ||2 939 040||3 530 352||2 949 761||3 653 461  
  |-    |- 
- | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||||||||   + | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||  
  |-    |- 
- |# mismatches per 100kbp||0.8||0.43||0.58||1.36||0.15||0.95||0.58   + |# mismatches per 100kbp||0.8||0.43||0.58||1.36  
  |-    |- 
- |# indels per 100kbp||5.71||2.98||4.45||9.56||1.77||8.02||6.88   + |# indels per 100kbp||5.71||2.98||4.45||9.56  
  |-    |- 
- |# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0||0||0   + |# N's per 100kbp ||0||0||0||0  
  |-    |- 
- | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''||||||||||||||   + | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''||||||||  
  |-    |- 
- |Genome fraction(%) ||100||100||99.815||99.87||100||99.995||99.979   + |Genome fraction(%) ||100||100||99.815||99.87  
  |-    |- 
- |Duplication ratio ||1.037||1.016||1.017||1.025||1.022||1.038||1.025   + |Duplication ratio ||1.037||1.016||1.017||1.025  
  |-    |- 
- |# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4480+7 part||4485+9 part||4494+3 part||4493+4 part||4492+5 part   + |# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4480+7 part||4485+9 part  
  |-    |- 
- |NGA50 ||615 234||1 205 052||572 342||875 953||844 482||633 220||1 267 242   + |NGA50 ||615 234||1 205 052||572 342||875 953  
  |-     |-  
- |'''Running Time'''||19hr 06m||13hr 34m||13hr 21m||12hr 38m||21hr 28m||22hr 56m||22hr 07m   + |'''Running Time'''||19hr 06m||13hr 34m||13hr 21m||12hr 38m  
  |-    |- 
  |}    |}