Version Differences for HGAP

(→Performance)
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Line 253:
  |Total length||5 178 932||5 176 592||5 176 771||5 182 410    |Total length||5 178 932||5 176 592||5 176 771||5 182 410 
  |-    |- 
- |N50||1 005 770 ||3 484 877||966 809||1 434 284   + |N50||2 934 267||2 927 454||2 929 942|2 133 457  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''|||||||| 
Line 259:
- |# misassemblies||19||9||12||15   + |# misassemblies||0||1||0||1  
  |-    |- 
- |Misassembled contigs length ||2 939 040||3 530 352||2 949 761||3 653 461   + |Misassembled contigs length ||0||2 240 169||0||13 124  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''|||||||| 
Line 265:
- |# mismatches per 100kbp||0.8||0.43||0.58||1.36   + |# mismatches per 100kbp||0||0.02||0.06||6.45  
  |-    |- 
- |# indels per 100kbp||5.71||2.98||4.45||9.56   + |# indels per 100kbp||1.05||0.54||0.6||1.88  
  |-    |- 
  |# N's per 100kbp ||0||0||0||0    |# N's per 100kbp ||0||0||0||0 
Line 271:
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''|||||||| 
  |-    |- 
- |Genome fraction(%) ||100||100||99.815||99.87   + |Genome fraction(%) ||100||100||100||99.936  
  |-    |- 
- |Duplication ratio ||1.037||1.016||1.017||1.025   + |Duplication ratio ||1.003||1.003||1.003||1.006  
  |-    |- 
- |# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4480+7 part||4485+9 part   + |# genes ||4338+1 part||4338+1 part||4338+1 part||4335+4 part  
  |-    |- 
- |NGA50 ||615 234||1 205 052||572 342||875 953   + |NGA50 ||2 934 267||2 927 454||2 929 942||2 133 457  
  |-     |-  
- |'''Running Time'''||19hr 06m||13hr 34m||13hr 21m||12hr 38m   + |'''Running Time'''||24hr 56m||17hr 41m||18hr 14m||17hr 04m  
  |-    |- 
  |}    |}