Version Differences for HGAP

(→Discard Lower-case bases)
(→Discard Lower-case bases)
Line 336:
  |# contigs||3||2||2||5    |# contigs||3||2||2||5 
  |-    |- 
- |Largest contig||2 943 267||2 927 454||2 929 942||2 226 051   + |Largest contig||2 932 503||2 925 498||2 925 998||2 225 051  
  |-    |- 
- |Total length||5 178 932||5 167 623||5 167 190||5 172 946   + |Total length||5 175 001||5 163 999||5 162 498||5 161 405  
  |-    |- 
- |N50||2 934 267||2 927 454||2 929 942||2 133 457   + |N50||2 932 503||2 925 498||2 925 998||2 131 500  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''|||||||| 
Line 346:
- |# misassemblies||0||1||0||1   + |# misassemblies||0||1||0||0  
  |-    |- 
- |Misassembled contigs length ||0||2 240 169||0||13 124   + |Misassembled contigs length ||0||2 238 501||0||0  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''|||||||| 
Line 352:
- |# mismatches per 100kbp||0||0.04||0.08||6.45   + |# mismatches per 100kbp||0.02||0.06||9.98||6.42  
  |-    |- 
- |# indels per 100kbp||1.05||0.68||0.6||1.82   + |# indels per 100kbp||0.77||0.56||0.85||1.45  
  |-    |- 
  |# N's per 100kbp ||0||0||0||0    |# N's per 100kbp ||0||0||0||0 
Line 358:
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''|||||||| 
  |-    |- 
- |Genome fraction(%) ||100||99.951||99.916||99.878   + |Genome fraction(%) ||100||99.931||99.869||99.782  
  |-    |- 
- |Duplication ratio ||1.003||1.002||1.002||1.004   + |Duplication ratio ||1.002||1.001||1.002||1.002  
  |-    |- 
- |# genes ||4338+1 part||4336+2 part||4335+3 part||4333+5 part   + |# genes ||4338+1 part||4336+2 part||4331+4 part||4328+7 part  
  |-    |- 
- |NGA50 ||2 934 267||2 927 454||2 929 942||2 133 457   + |NGA50 ||2 932 503||2 925 498||2 925 998||2 131 500  
  |-    |- 
  |}    |}