(→Performance)
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(→Performance)
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Line 389: | |||
|# contigs||5||10||4||11||7||8||6||10||5 | |# contigs||5||10||4||11||7||8||6||10||5 | ||
|- | |- | ||
- | |Largest contig||3 770 578||4 106 852||1 936 831||1 948 632||2 104 087||1 169 224||1 439 551 | + | |Largest contig||3 770 578||4 106 852||4 644 754||3 785 116||4 647 724||3 287 965||4 649 322||4 623 068||4 649 308 |
|- | |- | ||
- | |Total length||4 808 733||4 706 800||4 705 398||4 745 036||4 741 512||4 814 718||4 749 785 | + | |Total length||4 684 069||4 723 363||4 671 153||4 736 342||4 711 060||4 708 831||4 706 433||4 731 334||4 691 736 |
|- | |- | ||
- | |N50||1 005 770 ||3 484 877||966 809||1 434 284||1 655 500||676 526||1 268 010 | + | |N50||3 770 578||4 106 852||4 644 754||3 785 116||4 647 724||3 287 965||4 649 322||4 623 068||4 649 308 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''|||||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''|||||||||||||| | ||
Line 399: | |||
- | |# misassemblies||19||9||12||15||14||17||11 | + | |# misassemblies||10||13||13||15||12||11||11||16||12 |
|- | |- | ||
- | |Misassembled contigs length ||2 939 040||3 530 352||2 949 761||3 653 461||3 820 624||2 387 129||3 986 402 | + | |Misassembled contigs length ||3 788 648||4 700 016||4 671 153||4 726 005||4 685 712||3 339 030||4 694 303||4 698 068||4 649 308 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''|||||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''|||||||||||||| | ||
Line 405: | |||
- | |# mismatches per 100kbp||0.8||0.43||0.58||1.36||0.15||0.95||0.58 | + | |# mismatches per 100kbp||0.47||0.56||0.37||0.19||0.11||0.15||0.13||0.43||0.17 |
|- | |- | ||
- | |# indels per 100kbp||5.71||2.98||4.45||9.56||1.77||8.02||6.88 | + | |# indels per 100kbp||1.08||4.44||0.22||1.66||0.63||0.65||0.19||4.59||0.56 |
|- | |- | ||
- | |# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0||0||0 | + | |# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0||0||0||0||0 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''|||||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''|||||||||||||| | ||
Line 413: | |||
- | |Genome fraction(%) ||100||100||99.815||99.87||100||99.995||99.979 | + | |Genome fraction(%) ||100||100||99.994||99.999||100||100||100||99.99||100 |
|- | |- | ||
- | |Duplication ratio ||1.037||1.016||1.017||1.025||1.022||1.038||1.025 | + | |Duplication ratio ||1.01||1.018||1.007||1.021||1.031||1.015||1.012||1.02||1.011 |
|- | |- | ||
- | |# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4480+7 part||4485+9 part||4494+3 part||4493+4 part||4492+5 part | + | |# genes ||4495+2 part||4495+2 part||4493+3 part||4494+3 part||4495+2 part||4495+2 part||4495+2 part||4494+3 part||4495+2 part |
|- | |- | ||
|NGA50 ||615 234||1 205 052||572 342||875 953||844 482||633 220||1 267 242 | |NGA50 ||615 234||1 205 052||572 342||875 953||844 482||633 220||1 267 242 |