Version Differences for HGAP

| style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''||||||||||||||||||

|-

-

|# misassemblies||10||13||13||15||12||11||11||16||12

+

|# misassemblies||8||10||10||10||8||7||8||9||9

|-

-

|Misassembled contigs length ||3 788 648||4 700 016||4 671 153||4 726 005||4 685 712||3 339 030||4 694 303||4 698 068||4 649 308

+

|Misassembled contigs length ||3 770 578||4 677 561||4 644 754||4 675 943||4 647 724||3 301 396||4 664 502||4 639 404||4 649 308

|-

| style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||||||||||||

-

|# mismatches per 100kbp||0.47||0.56||0.37||0.19||0.11||0.15||0.13||0.43||0.17

+

|# mismatches per 100kbp||0.15||0.5||0.37||0.22||0.11||0.15||0.13||0.22||0.17

|-

-

|# indels per 100kbp||1.08||4.44||0.22||1.66||0.63||0.65||0.19||4.59||0.56

+

|# indels per 100kbp||0.47||3.34||0.22||1.47||0.63||0.65||0.19||1.44||0.56

|-

|# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0||0||0||0||0

|Genome fraction(%) ||100||100||99.994||99.999||100||100||100||99.99||100

|-

-

|Duplication ratio ||1.01||1.018||1.007||1.021||1.031||1.015||1.012||1.02||1.011

+

|Duplication ratio ||1.003||1.011||1.002||1.008||1.005||1.007||1.005||1.005||1.005

|-

-

|# genes ||4495+2 part||4495+2 part||4493+3 part||4494+3 part||4495+2 part||4495+2 part||4495+2 part||4494+3 part||4495+2 part

+

|# genes ||4494+3 part||4495+2 part||4493+3 part||4493+4 part||4495+2 part||4495+2 part||4495+2 part||4493+4 part||4495+2 part

|-

|NGA50 ||1 207 217||2 558 505||1 640 882||2 888 022||2 834 458||1 298 912||1 477 605||1 344 200||2 995 586

 | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''||||||||||||||||||
 |-
-								|# misassemblies||10||13||13||15||12||11||11||16||12
+								|# misassemblies||8||10||10||10||8||7||8||9||9
 |-
-								|Misassembled contigs length ||3 788 648||4 700 016||4 671 153||4 726 005||4 685 712||3 339 030||4 694 303||4 698 068||4 649 308
+								|Misassembled contigs length ||3 770 578||4 677 561||4 644 754||4 675 943||4 647 724||3 301 396||4 664 502||4 639 404||4 649 308
 |-
 | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||||||||||||
-								|# mismatches per 100kbp||0.47||0.56||0.37||0.19||0.11||0.15||0.13||0.43||0.17
+								|# mismatches per 100kbp||0.15||0.5||0.37||0.22||0.11||0.15||0.13||0.22||0.17
 |-
-								|# indels per 100kbp||1.08||4.44||0.22||1.66||0.63||0.65||0.19||4.59||0.56
+								|# indels per 100kbp||0.47||3.34||0.22||1.47||0.63||0.65||0.19||1.44||0.56
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 |# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0||0||0||0||0
 |Genome fraction(%) ||100||100||99.994||99.999||100||100||100||99.99||100
 |-
-								|Duplication ratio ||1.01||1.018||1.007||1.021||1.031||1.015||1.012||1.02||1.011
+								|Duplication ratio ||1.003||1.011||1.002||1.008||1.005||1.007||1.005||1.005||1.005
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-								|# genes ||4495+2 part||4495+2 part||4493+3 part||4494+3 part||4495+2 part||4495+2 part||4495+2 part||4494+3 part||4495+2 part
+								|# genes ||4494+3 part||4495+2 part||4493+3 part||4493+4 part||4495+2 part||4495+2 part||4495+2 part||4493+4 part||4495+2 part
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 |NGA50 ||1 207 217||2 558 505||1 640 882||2 888 022||2 834 458||1 298 912||1 477 605||1 344 200||2 995 586