Version Differences for HGAP
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(→Performance)
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(→Performance)
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| Line 501: | |||
| | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''|||||||||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| '''Misassemblies'''|||||||||||||||||| | ||
| |- | |- | ||
| - | |# misassemblies|||||||||||||||||| | + | |# misassemblies||8||10||10||9||8||7||8||9||8 |
| |- | |- | ||
| - | |Misassembled contigs length |||||||||||||||||| | + | |Misassembled contigs length ||3 768 995||4 666 999||4 644 254||4 660 999||4 646 000||3 299 005||4 660 992||4 638 338||4 647 000 |
| |- | |- | ||
| | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''|||||||||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''|||||||||||||||||| | ||
| Line 509: | |||
| - | |# mismatches per 100kbp|||||||||||||||||| | + | |# mismatches per 100kbp||0.15||0.5||0.37||0.19||0.11||0.11||0.13||0.22||0.17 |
| |- | |- | ||
| |# indels per 100kbp|||||||||||||||||| | |# indels per 100kbp|||||||||||||||||| | ||
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| | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''|||||||||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''|||||||||||||||||| | ||
| |- | |- | ||
| - | |Genome fraction(%) |||||||||||||||||| | + | |Genome fraction(%) ||100||100||99.994||99.999||100||100||100||99.99||100 |
| |- | |- | ||
| - | |Duplication ratio |||||||||||||||||| | + | |Duplication ratio ||1.002||1.008||1.002||1.005||1.004||1.006||1.005||1.005||1.004 |
| |- | |- | ||
| - | |# genes ||4494+3 part||4495+2 part||4493+3 part||4493+4 part||4495+2 part||4495+2 part||4495+2 part||4493+4 part||4495+2 part | + | |# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4493+3 part||4493+4 part||4495+2 part||4495+2 part||4495+2 part||4493+4 part||4495+2 part |
| |- | |- | ||
| - | |NGA50 |||||||||||||||||| | + | |NGA50 ||1 207 217||2 558 154||1 640 382||2 888 022||2 833 234||1 298 912||1 476 281||1 344 200||2 995 586 |
| |- | |- | ||
| |} | |} | ||