Version Differences for PBcR

(→Performance)
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Line 42:
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||||||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''|||||||||||||||||||| 
  |-    |- 
- |# mismatches per 100kbp||0.34||1.03||0.69||0.78||0.69||0.56||0.58||0.75||0.84||0.75   + |# mismatches per 100kbp||0.19||0.54||0.37||0.34||0.17||0.09||0.15||0.34||0.09||0.11  
  |-    |- 
- |# indels per 100kbp||0.6||7.44||5.78||5.67||1.88||2.72||1.66||1.6||1.9||2.65   + |# indels per 100kbp||1.59||24.54||22.42||15.82||6.38||10.22||5.63||4.38||5.32||6.06  
  |-    |- 
- |# N's per 100kbp ||0||0.02||0||0||0||0||0||0||0.02||0   + |# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0||0||0||0||0||0  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''||||||||||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''|||||||||||||||||| 
Line 52:
- |Genome fraction(%) ||100||100||100||99.949||99.956||100||100||99.959||100||99.993   + |Genome fraction(%) ||100||99.169||99.965||99.981||100||100||100||100||100||100  
  |-    |- 
- |Duplication ratio ||1.003||1.002||1.002||1.005||1.002||1.005||1.002||1.004||1.002||1.003   + |Duplication ratio ||1.002||1||1||1.003||1.003||1.001||1.002||1.002||1.002||1.002  
  |-    |- 
- |# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4494+3 part||4490+5 part||4491+2 part||4495+2 part||4494+3 part||4489+6 part||4494+3 part||4493+4 part   + |# genes ||4494+3 part||4458+8 part||4491+5 part||4491+6 part||4494+3 part||4494+3 part||4494+3 part||4494+3 part||4494+3 part||4493+3 part  
  |-    |- 
- |NGA50 ||2 834 925||949 217||949 242||656 513||2 796 469||1 040 965||3 026 388||949 298||3 027 267||949 289   + |NGA50 ||3 026 386||907 076||1 097 763||880 448||3 026 238||2 603 928||3 026 270||1 257 068||2 856 673||2 856 687  
- |-      
- | style="background:#f0f0f0;"| '''Running Time'''||||||||||||||||||||      
  |-    |- 
- |PacBioToCA||48hr 16m||4hr 58m||5hr 48m||5hr 10m||11hr 09m||9hr 34m||10hr 47m||21hr 06m||22hr 05m||21hr 23m   + |Run Time||12hr 14m||26m 16s||35m 50s||33m 3s||53m 36s||48m 9s||2hr 21m||2hr 43s||1hr 2m||53m 3s  
- |-      
- |runCA||15hr 48m||15hr 22m||13hr 50m||11hr 20m||12hr 38m||11hr 44m||13hr 48m||11hr 37m||14hr 36m||13hr 40m      
- |-      
- |Total||64hr 04m||20hr 20m||19hr 38m||16hr 30m||23hr 47m||21hr 18m||24hr 35m||32hr 43m||36hr 41m||25hr 03m      
  |}    |}