Version Differences for PBcR

(Performance)
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Line 573:
  |# contigs||[[Media:pbcr_d7_all_wog.fa | 1]]||[[Media:pbcr_d7_rg3_1.fa | 1]]||[[Media:pbcr_d7_rg3_2.fa | 1]]||[[Media:pbcr_d7_rg3_3.fa | 1]]||[[Media:pbcr_d7_rg3_4.fa | 1]]    |# contigs||[[Media:pbcr_d7_all_wog.fa | 1]]||[[Media:pbcr_d7_rg3_1.fa | 1]]||[[Media:pbcr_d7_rg3_2.fa | 1]]||[[Media:pbcr_d7_rg3_3.fa | 1]]||[[Media:pbcr_d7_rg3_4.fa | 1]] 
  |-     |-  
- |Largest contig||3 100 062||3 099 663||3 099 663||3 098 784||3 099 602   + |Largest contig||3 100 140||3 099 663||3 099 663||3 098 784||3 099 602  
  |-    |- 
- |Total length||3 100 062||3 099 663||3 099 663||3 098 784||3 099 602   + |Total length||3 100 140||3 099 663||3 099 663||3 098 784||3 099 602  
  |-    |- 
- |N50||3 100 062||3 099 663||3 099 663||3 098 784||3 099 602   + |N50||3 100 140||3 099 663||3 099 663||3 098 784||3 099 602  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| [[Media:SCA_d6.pdf | '''Misassemblies''']]||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| [[Media:SCA_d6.pdf | '''Misassemblies''']]|||||||||| 
Line 583:
- |# misassemblies||0||0||0||0||0   + |# misassemblies||1||0||0||0||0  
  |-    |- 
- |Misassembled contigs length ||0||0||0||0||0   + |Misassembled contigs length ||3 100 140||0||0||0||0  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''|||||||||| 
Line 589:
  |# mismatches per 100kbp||0.03||0.06||0.06||0.03||0.03    |# mismatches per 100kbp||0.03||0.06||0.06||0.03||0.03 
  |-    |- 
- |# indels per 100kbp||13.53||20.47||20.47||19.95||20.7   + |# indels per 100kbp||13.85||20.47||20.47||19.95||20.7  
  |-    |- 
  |# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0    |# N's per 100kbp ||0||0||0||0||0 
Line 599:
  |Duplication ratio ||1.001||1.001||1.001||1.001||1.001    |Duplication ratio ||1.001||1.001||1.001||1.001||1.001 
  |-    |- 
- |# genes ||3103 + 2part||3103 +2 part||3103 +2 part||3103 +2 part||3103 +2 part   + |# genes ||3103 + 2 part||3103 +2 part||3103 +2 part||3103 +2 part||3103 +2 part  
  |-    |- 
- |NGA50 ||3 100 062||3 099 663||3 099 663||3 098 784||3 099 602   + |NGA50 ||1 707 540||3 099 663||3 099 663||3 098 784||3 099 602  
  |-    |- 
  | align="left" style="background:#f0f0f0;"|''' Running Time '''||34m 24s||42m 32s||37m 55s||39m 37s||43m 28s    | align="left" style="background:#f0f0f0;"|''' Running Time '''||34m 24s||42m 32s||37m 55s||39m 37s||43m 28s