Version Differences for PBcR pipeline

| style="background:#f0f0f0;"| [[Media: SCA_D5.pdf | '''Misassemblies''']]||||||||||||||||||||

|-

-

|# misassemblies||9||7||8||7||7||10||10||6||10||8

+

|# misassemblies||9||9||8||9||7||9||10||7||10||8

|-

-

|Misassembled contigs length ||4 651 604||4 647 117||4 648 057||3 447 068||6 645 941||4 657 272||4 649 699||2 143 406||4 649 323||4 189 785

+

|Misassembled contigs length ||4 651 604||4 647 117||4 648 057||3 447 068||4 645 941||4 657 272||4 649 699||2 143 406||4 649 323||4 189 785

|-

| style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||||||||||||||

-

|# mismatches per 100kbp||0.34||1.03||0.69||0.78||0.69||0.56||0.58||0.75||0.86||0.75

+

|# mismatches per 100kbp||0.34||1.03||0.69||0.78||0.69||0.56||0.58||0.75||0.84||0.75

|-

-

|# indels per 100kbp||0.65||7.65||5.78||5.78||1.88||2.89||1.75||1.62||2||2.65

+

|# indels per 100kbp||0.6||7.44||5.78||5.67||1.88||2.72||1.66||1.6||1.9||2.65

|-

|# N's per 100kbp ||0||0.02||0||0||0||0||0||0||0.02||0

|# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4494+3 part||4490+5 part||4491+2 part||4495+2 part||4494+3 part||4489+6 part||4494+3 part||4493+4 part

|-

-

|NGA50 ||1 207 212||1 428 636||1 432 247||983 650||1 552 642||873 232||2 995 552||1 062 313||2 956 338||1 207 192

+

|NGA50 ||2 834 925||949 217||949 242||656 513||2 796 469||1 040 965||3 026 388||949 298||3 027 267||949 289

|-

| style="background:#f0f0f0;"| '''Running Time'''||||||||||||||||||||

 | style="background:#f0f0f0;"| [[Media: SCA_D5.pdf | '''Misassemblies''']]||||||||||||||||||||
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-								|# misassemblies||9||7||8||7||7||10||10||6||10||8
+								|# misassemblies||9||9||8||9||7||9||10||7||10||8
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-								|Misassembled contigs length ||4 651 604||4 647 117||4 648 057||3 447 068||6 645 941||4 657 272||4 649 699||2 143 406||4 649 323||4 189 785
+								|Misassembled contigs length ||4 651 604||4 647 117||4 648 057||3 447 068||4 645 941||4 657 272||4 649 699||2 143 406||4 649 323||4 189 785
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 | style="background:#f0f0f0;"| '''Mismatches'''||||||||||||||||||||
-								|# mismatches per 100kbp||0.34||1.03||0.69||0.78||0.69||0.56||0.58||0.75||0.86||0.75
+								|# mismatches per 100kbp||0.34||1.03||0.69||0.78||0.69||0.56||0.58||0.75||0.84||0.75
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-								|# indels per 100kbp||0.65||7.65||5.78||5.78||1.88||2.89||1.75||1.62||2||2.65
+								|# indels per 100kbp||0.6||7.44||5.78||5.67||1.88||2.72||1.66||1.6||1.9||2.65
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 |# N's per 100kbp ||0||0.02||0||0||0||0||0||0||0.02||0
 |# genes ||4494+3 part||4494+3 part||4494+3 part||4490+5 part||4491+2 part||4495+2 part||4494+3 part||4489+6 part||4494+3 part||4493+4 part
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-								|NGA50 ||1 207 212||1 428 636||1 432 247||983 650||1 552 642||873 232||2 995 552||1 062 313||2 956 338||1 207 192
+								|NGA50 ||2 834 925||949 217||949 242||656 513||2 796 469||1 040 965||3 026 388||949 298||3 027 267||949 289
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 | style="background:#f0f0f0;"| '''Running Time'''||||||||||||||||||||