Version Differences for PBcR pipeline

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Line 106:
  | style="background:#f0f0f0;"| [[Media:SCA_d6.pdf | '''Misassemblies''']]||||||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| [[Media:SCA_d6.pdf | '''Misassemblies''']]|||||||||||||| 
  |-    |- 
- |# misassemblies||8||10||8||6||7||7||8   + |# misassemblies||9||9||9||8||8||8||9  
  |-    |- 
  |Misassembled contigs length ||4 278 957||2 809 129||2 085 482||1 947 163||4 641 350||4 640 250||3 209 090    |Misassembled contigs length ||4 278 957||2 809 129||2 085 482||1 947 163||4 641 350||4 640 250||3 209 090 
Line 114:
  |# mismatches per 100kbp||0.37||2.49||1.88||5.38||0.69||0.67||0.86    |# mismatches per 100kbp||0.37||2.49||1.88||5.38||0.69||0.67||0.86 
  |-    |- 
- |# indels per 100kbp||3.64||56.81||47.62||77.31||10.67||12.87||11   + |# indels per 100kbp||3.58||53.34||45.82||73.07||10.65||11.28||10.46  
  |-    |- 
  |# N's per 100kbp ||0||0.04||0.02||0.09||0||0||0    |# N's per 100kbp ||0||0.04||0.02||0.09||0||0||0 
Line 120:
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''||||||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Genome Statistics'''|||||||||||||| 
  |-    |- 
- |Genome fraction(%) ||99.93||99.733||99.67||99.693||99.972||99.946||99.968   + |Genome fraction(%) ||99.993||99.733||99.67||99.693||99.972||99.946||99.968  
  |-    |- 
- |Duplication ratio ||1.003||1.006||1.005||1.008||1.001||1.001||1.005   + |Duplication ratio ||1.002||1.005||1.006||1.007||1.001||1.001||1.003  
  |-    |- 
  |# genes ||4492+5 part||4475+10 part||4467+12 part||4469+13 part||4492+4 part||4491+4 part||4492+4 part    |# genes ||4492+5 part||4475+10 part||4467+12 part||4469+13 part||4492+4 part||4491+4 part||4492+4 part 
Line 128:
- |NGA50 ||1 207 233||531 351||721 189||565 251||2 499 057||2 499 697||1 267 262   + |NGA50 ||859 464||621 281||572 455||436 292||1 098 529||1 096 784||859 502  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| '''Running Time'''||||||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| '''Running Time'''||||||||||||||