| Line 98: |
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| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''4_asm.ctg''' |
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| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''4_asm.ctg''' |
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|- |
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|- |
| - |
| # contigs||||||||||
|
+ |
| # contigs||26||23||18||17||14
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|- |
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|- |
| - |
| Largest contig||||||||||
|
+ |
| Largest contig||500519||1040768||671836||803212||1099298
|
| |
|- |
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|- |
| - |
| Total length||||||||||
|
+ |
| Total length||4663672||4668811||4688223||4693002||4703352
|
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|- |
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|- |
| - |
| N50||||||||||
|
+ |
| N50||245130||484760||462620||508833||544950
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|- |
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|- |
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| style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||| |
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| style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||| |
| Line 110: |
| - |
| # misassemblies||||||||||
|
+ |
| # misassemblies||8||10||12||6||14
|
| |
|- |
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|- |
| - |
| Misassembled contigs length||||||||||
|
+ |
| Misassembled contigs length||953282||2407429||1989199||1480741||2703788
|
| |
|- |
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|- |
| - |
| Mismatches||||||||||
|
+ |
| style="background:#f0f0f0;"| Mismatches||||||||||
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|- |
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|- |
| - |
| # mismatches per 100 kbp||||||||||
|
+ |
| # mismatches per 100 kbp||8.76||8.5||8.99||9.48||7.01
|
| |
|- |
|
|- |
| - |
| # indels per 100 kbp||||||||||
|
+ |
| # indels per 100 kbp||2.72||1.82||2.59||0.97||0.69
|
| |
|- |
|
|- |
| - |
| # N's per 100 kbp||||||||||
|
+ |
| # N's per 100 kbp||0.09||0.04||0.02||0.02||0
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|- |
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|- |
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| style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||| |
|
| style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||| |
| Line 124: |
| - |
| Genome fraction (%)||||||||||
|
+ |
| Genome fraction (%)||99.895||99.596||99.746||99.548||99.931
|
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|- |
|
|- |
| - |
| Duplication ratio||||||||||
|
+ |
| Duplication ratio||1.006||1.012||1.015||1.017||1.015
|
| |
|- |
|
|- |
| - |
| # genes|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part
|
+ |
| # genes||4478 + 16 part||4474 + 12 part||4477 + 9 part||4470 + 8 part||4489 + 6 part
|
| |
|- |
|
|- |
| - |
| NGA50||||||||||
|
+ |
| NGA50||187140||484760||391908||506966||526088
|
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|- |
|
|- |
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|} |
|
|} |
