Version Differences for Read Depths
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| | align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''2_118X_25X_asm.ctg''' | | align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''2_118X_25X_asm.ctg''' | ||
| |- | |- | ||
| - | | # contigs|||||||||||| | + | | # contigs||16||17||22||33||35||32 |
| |- | |- | ||
| - | | Largest contig|||||||||||| | + | | Largest contig||762045||757702||767781||405645||520095||570062 |
| |- | |- | ||
| - | | Total length|||||||||||| | + | | Total length||4650035||4675233||4651814||4574523||4648591||4588060 |
| |- | |- | ||
| - | | N50|||||||||||| | + | | N50||514903||405539||331262||193986||194625||223426 |
| |- | |- | ||
| | style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||| | ||
| Line 189: | |||
| - | | # misassemblies|||||||||||| | + | | # misassemblies||4||6||10||4||5||8 |
| |- | |- | ||
| - | | Misassembled contigs length|||||||||||| | + | | Misassembled contigs length||1564680||1697372||1683620||141677||569893||1424613 |
| |- | |- | ||
| | Mismatches|||||||||||| | | Mismatches|||||||||||| | ||
| Line 195: | |||
| - | | # mismatches per 100 kbp|||||||||||| | + | | # mismatches per 100 kbp||2.43||2.23||4.94||1.8||5.56||5.97 |
| |- | |- | ||
| - | | # indels per 100 kbp|||||||||||| | + | | # indels per 100 kbp||1.76||0..84||6.19||1.8||4.48||2.86 |
| |- | |- | ||
| - | | # N's per 100 kbp|||||||||||| | + | | # N's per 100 kbp||0.06||0||0.26||0||0.13||0.04 |
| |- | |- | ||
| | style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||||| | ||