(→Evaluation)
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(→Evaluation)
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Line 266: | |||
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''3_118X_25X_asm.ctg''' | | align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''3_118X_25X_asm.ctg''' | ||
|- | |- | ||
- | | # contigs|||||||||||| | + | | # contigs||29||15||20||18||27||29 |
|- | |- | ||
- | | Largest contig|||||||||||| | + | | Largest contig||771076||1426293||981876||822480||1091515||520962 |
|- | |- | ||
- | | Total length|||||||||||| | + | | Total length||4672216||4666874||4656670||4613610||4650236||4593856 |
|- | |- | ||
- | | N50|||||||||||| | + | | N50||316212||323732||413464||600008||286035||218547 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||| | ||
Line 278: | |||
- | | # misassemblies|||||||||||| | + | | # misassemblies||6||4||10||6||7||7 |
|- | |- | ||
- | | Misassembled contigs length|||||||||||| | + | | Misassembled contigs length||1270144||1321332||2130162||1844194||1736227||1326538 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| Mismatches|||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Mismatches|||||||||||| | ||
Line 284: | |||
- | | # mismatches per 100 kbp|||||||||||| | + | | # mismatches per 100 kbp||2.07||2.14||1.67||1.48||4.35||5.09 |
|- | |- | ||
- | | # indels per 100 kbp|||||||||||| | + | | # indels per 100 kbp||0.98||0.65||5.54||3.31||2.88||3.76 |
|- | |- | ||
- | | # N's per 100 kbp|||||||||||| | + | | # N's per 100 kbp||0.06||0||0.17||0.02||0.04||0 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||||| | ||
Line 292: | |||
- | | Genome fraction (%)|||||||||||| | + | | Genome fraction (%)||99.037||99.636||99.615||99.087||99.478||98.614 |
|- | |- | ||
- | | Duplication ratio||||||||||| | + | | Duplication ratio||1.017||1.01||1.008||1.004||1.009|1.005 |
|- | |- | ||
- | | # genes|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part | + | | # genes||4439 + 24 part||4467 + 11 part||4472 + 19 part||4454 + 22 part||4457 + 21 part||4410 + 35 part |
|- | |- | ||
- | | NGA50|||||||||||| | + | | NGA50||286997||323732||348693||599239||286035||193471 |
|- | |- | ||
|} | |} |