(→Evaluation)
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(→Evaluation)
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Line 354: | |||
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''4_118X_25X_asm.ctg''' | | align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''4_118X_25X_asm.ctg''' | ||
|- | |- | ||
- | | # contigs|||||||||||| | + | | # contigs||40||12||21||12||21||26 |
|- | |- | ||
- | | Largest contig|||||||||||| | + | | Largest contig||532128||1812746||688723||1257198||983533||621920 |
|- | |- | ||
- | | Total length|||||||||||| | + | | Total length||4726973||4659487||4656544||4602600||4654299||4508804 |
|- | |- | ||
- | | N50|||||||||||| | + | | N50||180844||834736||398131||1071366||412226||285200 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||| | ||
Line 366: | |||
- | | # misassemblies|||||||||||| | + | | # misassemblies||7||8||8||6||15||9 |
|- | |- | ||
- | | Misassembled contigs length|||||||||||| | + | | Misassembled contigs length||736689||3595196||2252884||2698687||2362706||1274915 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| Mismatches|||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Mismatches|||||||||||| | ||
Line 372: | |||
- | | # mismatches per 100 kbp|||||||||||| | + | | # mismatches per 100 kbp||2.35||2.28||2.53||2||4.41||6.26 |
|- | |- | ||
- | | # indels per 100 kbp|||||||||||| | + | | # indels per 100 kbp||0.87||0.75||3.94||3.81||3.31||4.49 |
|- | |- | ||
- | | # N's per 100 kbp|||||||||||| | + | | # N's per 100 kbp||0.17||0.13||0.02||0.04||0.04||0 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||||| | ||
Line 380: | |||
- | | Genome fraction (%)|||||||||||| | + | | Genome fraction (%)||99.193||99.215||99.62||98.967||99.687||97.023 |
|- | |- | ||
- | | Duplication ratio||||||||||| | + | | Duplication ratio||1.028||1.012||1.008||1.003||1.009||1.003 |
|- | |- | ||
- | | # genes|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part | + | | # genes||4443 + 26 part||4456 + 12 part||4474 + 17 part||4452 + 11 part||4474 + 15 part||4344 + 37 part |
|- | |- | ||
- | | NGA50|||||||||||| | + | | NGA50||182232||476726||317322||694380||286770||247828 |
|- | |- | ||
|} | |} |