Version Differences for Read Depths

(Evaluation)
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Line 134:
  | align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''210845_118X_asm.ctg'''    | align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''210845_118X_asm.ctg''' 
  |-    |- 
- | # contigs||||||||||||||   + | # contigs||19||24||21||28||38||29||31  
  |-    |- 
- | Largest contig||||||||||||||   + | Largest contig||745120||664876||592203||663399||434084||345313||437164  
  |-    |- 
- | Total length||||||||||||||   + | Total length||4669108||4675696||4700617||4636263||4644391||4603072||4578972  
  |-    |- 
- | N50||||||||||||||   + | N50||356974||222559||399011||295449||180706||207976||191458  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies||||||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||||| 
Line 146:
- | # misassemblies||||||||||||||   + | # misassemblies||7||6||11||6||5||7||6  
  |-    |- 
- | Misassembled contigs length||||||||||||||   + | Misassembled contigs length||1539749||936587||2058922||1200212||727024||1097466||478971  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| Mismatches||||||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| Mismatches|||||||||||||| 
Line 152:
- | # mismatches per 100 kbp||||||||||||||   + | # mismatches per 100 kbp||2.75||2.75||3.04||7.08||5.85||8.82||3.69  
  |-    |- 
- | # indels per 100 kbp||||||||||||||   + | # indels per 100 kbp||2.23||1.1||1.17||13.46||5.83||2.49||2.37  
  |-    |- 
- | # N's per 100 kbp||||||||||||||   + | # N's per 100 kbp||0.19||0.02||0.04||0.26||0.15||0.07||0.02  
  |-    |- 
  | style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics||||||||||||||    | style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||||||| 
Line 160:
- | Genome fraction (%)||||||||||||||   + | Genome fraction (%)||99.639||99.699||99.834||99.984||99.051||98.78||98.159  
  |-    |- 
- | Duplication ratio||||||||||||||   + | Duplication ratio||1.011||1.011||1.017||1.01||1.015||1.005||1.006  
  |-    |- 
- | # genes|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part   + | # genes||4473 + 15 part||4465 + 18 part||4480 + 10 part||4435 + 29 part||4431 + 36 part||4413 + 36 part||4380 + 34 part  
  |-    |- 
- | NGA50||||||||||||||   + | NGA50||357183||221098||279423||226118||179662||194634||191457  
  |-    |- 
  |}    |}