(→Evaluation)
|
(→Evaluation)
|
Line 134: | |||
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''210845_118X_asm.ctg''' | | align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''210845_118X_asm.ctg''' | ||
|- | |- | ||
- | | # contigs|||||||||||||| | + | | # contigs||19||24||21||28||38||29||31 |
|- | |- | ||
- | | Largest contig|||||||||||||| | + | | Largest contig||745120||664876||592203||663399||434084||345313||437164 |
|- | |- | ||
- | | Total length|||||||||||||| | + | | Total length||4669108||4675696||4700617||4636263||4644391||4603072||4578972 |
|- | |- | ||
- | | N50|||||||||||||| | + | | N50||356974||222559||399011||295449||180706||207976||191458 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Misassemblies|||||||||||||| | ||
Line 146: | |||
- | | # misassemblies|||||||||||||| | + | | # misassemblies||7||6||11||6||5||7||6 |
|- | |- | ||
- | | Misassembled contigs length|||||||||||||| | + | | Misassembled contigs length||1539749||936587||2058922||1200212||727024||1097466||478971 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| Mismatches|||||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Mismatches|||||||||||||| | ||
Line 152: | |||
- | | # mismatches per 100 kbp|||||||||||||| | + | | # mismatches per 100 kbp||2.75||2.75||3.04||7.08||5.85||8.82||3.69 |
|- | |- | ||
- | | # indels per 100 kbp|||||||||||||| | + | | # indels per 100 kbp||2.23||1.1||1.17||13.46||5.83||2.49||2.37 |
|- | |- | ||
- | | # N's per 100 kbp|||||||||||||| | + | | # N's per 100 kbp||0.19||0.02||0.04||0.26||0.15||0.07||0.02 |
|- | |- | ||
| style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||||||| | | style="background:#f0f0f0;"| Genome statistics|||||||||||||| | ||
Line 160: | |||
- | | Genome fraction (%)|||||||||||||| | + | | Genome fraction (%)||99.639||99.699||99.834||99.984||99.051||98.78||98.159 |
|- | |- | ||
- | | Duplication ratio|||||||||||||| | + | | Duplication ratio||1.011||1.011||1.017||1.01||1.015||1.005||1.006 |
|- | |- | ||
- | | # genes|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part|| + part | + | | # genes||4473 + 15 part||4465 + 18 part||4480 + 10 part||4435 + 29 part||4431 + 36 part||4413 + 36 part||4380 + 34 part |
|- | |- | ||
- | | NGA50|||||||||||||| | + | | NGA50||357183||221098||279423||226118||179662||194634||191457 |
|- | |- | ||
|} | |} |